Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms