Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms