Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37bQ8R0J7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms