Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms