Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms