Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms