Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms