Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prkd3Q8K1Y2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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