Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Cmc2Q8K199 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cmc2Q8K199 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cmc2Q8K199 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms