Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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FgbQ8K0E8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FgbQ8K0E8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms