Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syn3Q8JZP2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms