Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms