Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rab11fip3Q8CHD8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip3Q8CHD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab11fip3Q8CHD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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