Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms