Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms