Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms