Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Snx30Q8CE50 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Snx30Q8CE50 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Snx30Q8CE50 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms