Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms