Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad2Q8CDM1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad2Q8CDM1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms