Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vwa8Q8CC88 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vwa8Q8CC88 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vwa8Q8CC88 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vwa8Q8CC88 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Vwa8Q8CC88 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vwa8Q8CC88 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vwa8Q8CC88 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms