Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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