Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms