Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms