Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4930507D05RikQ8C9C9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.2 ms