Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sit1Q8C503 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sit1Q8C503 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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