Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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