Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms