Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trerf1Q8BXJ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms