Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms