Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps13cQ8BX70 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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