Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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