Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms