Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod1Q8BVA4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod1Q8BVA4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms