Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep55Q8BT07 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms