Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms