Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efemp1Q8BPB5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms