Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP78

Fra10ac1, Protein FRA10AC1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fra10ac1Q8BP78 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fra10ac1Q8BP78 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms