Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms