Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp54Q8BL06 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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