Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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