Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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