Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp2bQ8BJF9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms