Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms