Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot10Q8BH15 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot10Q8BH15 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms