Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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