Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atg4bQ8BGE6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Atg4bQ8BGE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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