Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt12Q8BG71 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms