Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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