Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms