Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms