Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cracr2bQ80ZJ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms